El Lago de Yojoa, se encuentra localizado en la cuenca del Río Ulúa, y sus límites geográficos lo vinculan a tres departamentos: Santa Bárbara, Comayagua y Cortés.
Uno de los aspectos de mayor importancia para lograr el desarrollo turístico de la zona es la conservación de las áreas restantes que representan los hábitat originales de la zona, como por ejemplo la comunidad de jungla que es la que presenta mayor diversidad en fauna, dotando a ésta de los requerimientos alimenticios sobre todo de los ramoneadores, venado cola blanca (Odocoileus virginianus), venado rojo (Mazama americana), chancho de monte (Tayassu tajacu) y para otra fauna como chachas (Ortalis vetula), perdices y tucanes.
Uno de los atractivos principales en el Lago de Yojoa es su alta diversidad de especies de avifauna, en el cual se presenta la mayor concentración de especies dentro del país que como especies individuales son dependientes de estos hábitats tales como el Clis clis (Falco esparverius) y el Chipre de grace (Dendroica gracie).
El ecosistema de pantano faunísticamente es uno de los más ricos de todos los que se encuentran en el Lago. Mantiene una avifauna muy diversa como la garza blanca (Casmerodius albus), gallito de agua (Gallinula chloropus), soldadito colorado (Laterallus ruber) y ajoque (Aramus guarauna).
La zona del Lago de Yojoa es un sitio único para la observación de aves, ya que allí se agrupan más de 370 especies de aves de la cuales todas son de interés para los observadores de aves, pero principalmente las endémicas del trópico, como el quetzal (Pharomachrus mocinno), las auroras (Trogon sp.), tucanes (Ramphastus sp.) y otras.
En esta zona también se hayan ecosistemas de alturas en los que se encuentran especies endémicas de animales para el país, como el colibrí hondureño (Amazilia luciae).
Además de las aves que son atracción turística para el observador de pájaros, hay otros animales que sirven de atractivo para mejorar la visita al Lago, tales como la nutria y los monos que enriquecen la experiencia de cualquier turista en la región.
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